Le pôle des microtechniques: pour les marchés de la miniaturisation : plus de puissance, plus d'intelligence, plus de précision, plus de performance, tout en réduisant l'encombrement, le poids, la consommation d'énergie et de matière.
Le pôle Véhicule du Futur: solutions de niveau mondial au service des véhicules et des mobilités du futur véhicule propre, véhicules et réseaux intelligents, excellence de la filière.
Le pôle plasturgie – Plastipolis: qui apporte des solutions au niveau plasturgie. Son périmètre concerne les régions Franche-Comté et Rhône-Alpes.
Le Pôle Energie de Franche-Comté : travaille sur les enjeux du développement durable et sur la maîtrise des coûts de consommation d’énergie
Le pôle goût-nutrition-santé – Vitagora : apporte des solutions pour réconcilier goût-plaisir et santé (recherche scientifique et transfert de technologie)